Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP7P55210 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP7P55210 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP7P55210 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP7P55210 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP7P55210 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms