Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1B3P54709 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1B3P54709 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms