Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCL1P53675 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCL1P53675 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms