Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGDP52209 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGDP52209 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms