Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK4P51957 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK4P51957 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEK4P51957 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEK4P51957 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK4P51957 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK4P51957 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK4P51957 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK4P51957 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK4P51957 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms