Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1EP49674 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms