Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GCLMP48507 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCLMP48507 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GCLMP48507 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCLMP48507 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms