Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHKA1P46020 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms