Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSFMP43897 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TSFMP43897 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSFMP43897 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSFMP43897 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSFMP43897 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TSFMP43897 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms