Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKX2-1P43699 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms