Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RAD52P43351 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD52P43351 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD52P43351 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD52P43351 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD52P43351 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD52P43351 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAD52P43351 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD52P43351 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms