Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SSFA2P28290 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms