Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms