Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB4P28070 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms