Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMA4P25789 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms