Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRZ1P23471 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRZ1P23471 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms