Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK11BP21127 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms