Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BCL3P20749 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BCL3P20749 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BCL3P20749 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BCL3P20749 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms