Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCNA2P20248 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCNA2P20248 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms