Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPI1P17947 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPI1P17947 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPI1P17947 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPI1P17947 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms