Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL3L1P16619 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3L1P16619 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms