Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFAPP14136 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GFAPP14136 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFAPP14136 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFAPP14136 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms