Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC5A1P13866 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms