Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ODC1P11926 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ODC1P11926 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ODC1P11926 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ODC1P11926 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ODC1P11926 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ODC1P11926 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms