Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GLI4P10075 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms