Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP1P09455 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP1P09455 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP1P09455 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP1P09455 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms