Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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