Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms