Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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