Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms