Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLXNB1O43157 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PLXNB1O43157 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PLXNB1O43157 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms