Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOCS1O15524 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOCS1O15524 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms