Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CDO00329 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CDO00329 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms