Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LINC00587B1AMM8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms