Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGPD3A6NKT7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGPD3A6NKT7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms