Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6L3A6NEY3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms