Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VWA3AA6NCI4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWA3AA6NCI4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms