Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms