Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F8A0AVK6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
E2F8A0AVK6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms