Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX8Q9Y5X2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms