Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms