Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
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TPCN1Q9ULQ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TPCN1Q9ULQ1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TPCN1Q9ULQ1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPCN1Q9ULQ1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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