Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN1Q9ULB1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN1Q9ULB1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms