Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA2Q9UL42 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PNMA2Q9UL42 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms