Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC9Q9UKV0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms