Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HCN3Q9P1Z3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms