Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms