Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDP1Q9P0J1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms