Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMP5Q9NZZ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms