Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNIP1Q9NZI2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms